El servicio de análisis clínicos del HCV está en funcionamiento desde el año 1990 y se encuentra en constante actualización de técnicas diagnósticas y renovación de equipos. En la actualidad cuenta con equipamiento de última generación para la realización de análisis hematológicos, bioquímicos, hormonales y de orina. El servicio de laboratorio supone un apoyo al resto de los servicios del hospital en el proceso del diagnóstico y es también una parte fundamental en el seguimiento que se realiza a los pacientes externos y a los animales hospitalizados.

En el laboratorio trabaja un equipo formado por una técnico de laboratorio, becarios  y estudiantes de veterinaria, bajo la supervisión de la profesora Mª del Carmen Muñoz.